primer5.0安装包(primer5)

2022-05-12 19:12:02花剑晨
导读 大家好,精选小编来为大家解答以上问题。primer5 0安装包,primer5很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!1、首先下载、安装并激活Prime

大家好,精选小编来为大家解答以上问题。primer5.0安装包,primer5很多人还不知道,现在让我们一起来看看吧!

1、 首先下载、安装并激活Primer Premier 5软件,打开软件,点击左上角,选择“文件”“新建”“DNA序列”,然后复制参考模板DNA序列,在输入框点击Ctrl V,将DNA序列粘贴到3360中。

2、 然后点击左上角的“Primer”按钮,再点击“Search”按钮:

3、 然后选择并输入一些参数。一般点击顶部的“PCR引物”,底部的“Pairs”,然后输入上游(正义)和下游(反义)引物的设计位置范围。这就需要你提前知道你要放大的片段在哪里,并大致估算一下。比如我想扩增参考模板序列200-2100中间的1900bp长度。然后输入PCR产物大小范围,很简单。比如我要200-2100中间的1900bp,那么最小的PCR产物大小应该是1900bp。当然一般软件设计都会大于这个长度,所以最大长度可以无限制,但是越长越难扩展,所以适度就好。这里我将输入参考模板的最大长度;然后选择设计的引物长度区间,一般为233bp或5bp。引物长度越长,一般退火温度越高。对于搜索模式,通常选择自动:

4、 然后按左下角的“确定”按钮,在弹出的窗口中再次点击“确定”:

5、 这时,软件会在右上角的窗口中自动显示设计好的引物。默认情况下,引物从高到低排列。选定某一条引物后,该引物的一些参数会出现在左下角,让我们判断它的好坏,比如发夹结构、二聚体、错配、引物长度、起始位置、GC含量等。可以根据自己的要求选择适合自己的底漆。如果是白色,建议选择得分最高的底漆。

6、 最后,导出我们想到的引物对信息,点击文件”“打印”“当前对”,选择要打印的引物对。一般虚拟PDF打印机如Adobe,富鑫,Doro等。确认后可用于选择引物对的位置和名称。以后我们可以打开导出的PDF软件浏览引物对信息,将信息复制后发送给相应的生物公司进行引物对。

本文到此结束,希望对大家有所帮助。

免责声明:本文由用户上传,如有侵权请联系删除!